地面水常常受到土壤、工業(yè)廢水、生活污水及各種雜質(zhì)的污染，促使細(xì)菌滋生，有時(shí)每毫升水中細(xì)菌數(shù)可達(dá)幾萬(wàn)乃至幾十萬(wàn)個(gè)；在有的水域里，大腸桿菌甚至達(dá)數(shù)萬(wàn)個(gè)以上。雖然在水處理的過程中，經(jīng)過混凝、沉淀(或澄清)、過濾等的凈化過程，粘附在懸浮物上的大部分細(xì)菌、大腸桿菌、病原菌和其他一些微生物也一同被除去。但是，并不徹底，還存在一定量的對(duì)人體有毒害的微生物。

為了保障人的健康，防止疾病的傳播，還必須進(jìn)行水的消毒，以殺滅水中的病毒。我國(guó)“生活飲用水水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)”中規(guī)定，在水樣中細(xì)菌總數(shù)不超過100個(gè)／mL。總大腸菌群或糞大腸菌群每lOOmL水樣中均不得檢出。

為此，在混凝澄清過濾之后還需進(jìn)行消毒。在工業(yè)冷卻水處理中，為了防止循環(huán)水產(chǎn)生生物黏泥，要控制循環(huán)水中的異養(yǎng)菌數(shù)不超過1X105個(gè)／mL，因此，對(duì)于作為循環(huán)水系統(tǒng)補(bǔ)充水的過濾水，亦需要進(jìn)行消毒殺菌處理。在除鹽水處理系統(tǒng)，為了防止離子交換樹脂受到細(xì)菌的污染，也需要對(duì)其原水進(jìn)行消毒殺菌。此外，消毒還可以除去水的色度。